Goksjø har en god sammensatt fiskebestand. Det er betydelig innslag av stor abbor, dvs fiskespisende individer over 20-25 cm. Gjedda er også forholdsvis storvokst.
Fuglefaunaen i Goksjø er rik. Det kan sees flere hekkende koppsvaner, svanene spiser vannvegetasjon og rensker i så måte opp noe av den uønskede vegetasjonen.Vi kan også se svaner som ligger i åpent vann i Goksjø om vinteren. Andre fulgearter er storskarv, som er å se i store flokker. Disse tar godt for seg av småfisken. Vi har også flere arter av ender.
Av pattedyr er mest kjent bever og mink. Det er flere bevere i Goksjø og er man ute med kano eller båt en tidlig morgen eller sen kveld kan man være heldig å treffe på denne sky krabaten. Det er egen kvote for felling av bever. Minken er ikke en naturlig art i norsk fauna. Den har spredt seg over hele Norge etter rømninger fra pelsdyroppdrett. Det er stedvis store bestander av arten, og kan gjøre innhogg i bestanden av ender ved å spise egg og unger.
